KSeF ID to numer referencyjny nadawany przez KSeF każdej fakturze ustrukturyzowanej. Przy ręcznym wgrywaniu pliku XML z KSeF system spróbuje odczytać go automatycznie — jednak użytkownik musi zweryfikować KSeF ID i w razie potrzeby wkleić go ręcznie, zgodnie z oryginalną nazwą pliku. Jest to pole obowiązkowe.